Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4791J3QQ14 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms