Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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