Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms