Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20795J3QP49 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms