Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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