Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3727J3QM54 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3727J3QM54 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3727J3QM54 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3727J3QM54 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3727J3QM54 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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