Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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