Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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