Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms