Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms