Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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