Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm20538F6Z9R1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms