Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crocc2F6XLV1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms