Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8247F6VRJ8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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