Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28305F6U473 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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