Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms