Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms