Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BC051665E9Q623 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC051665E9Q623 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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