Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms