Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sfta2E9PXB6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms