Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms