Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms