Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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