Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm6685D3YYP3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm6685D3YYP3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm6685D3YYP3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm6685D3YYP3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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