Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7aB2RT54 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7aB2RT54 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms