Protein–RNA interactions for Protein: B2RSH2

Gnai1, Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnai1B2RSH2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnai1B2RSH2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms