Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rrn3B2RS91 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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