Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms