Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfx1B1AY10 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms