Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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