Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms