Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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H2-M5A7VMS3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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