Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms