Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms