Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms