Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms