Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc194A0A140LIT1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc194A0A140LIT1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc194A0A140LIT1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc194A0A140LIT1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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