Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hsd11b1-205ENSMUST00000161737 1355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms