Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms