Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt27Q9Z320 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Krt27Q9Z320 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt27Q9Z320 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms