Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3Q9Z2D8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms