Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr1Q9Z2C4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms