Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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