Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uso1Q9Z1Z0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uso1Q9Z1Z0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms