Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms