Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Cldn9Q9Z0S7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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