Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms