Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms