Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms