Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms